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Titanus und seine Mutanten verfolgen weiterhin die einzigartigen elektronischen Signale des Flux Transformers, um ihn zu orten und zurückzuholen. Die Turtles haben unterdessen alle Hände voll zu tun, als ein Vollstrecker namens Krakus auftaucht. Sie müssen herausfinden, wer Krakus ist und ob er Freund oder Feind ist.