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Tomoro Tenma lebt in einer Welt, in der menschliche Gedanken und Emotionen – bekannt als „E-Pulse“ – KI-Geräte namens Sapotama antreiben. Doch als Digimon aus Sapotama materialisieren und sich von E-Pulse ernähren, bricht die Gesellschaft auseinander. Nachdem Gekkomon aus seinem Gerät erscheint, schließt sich Tomoro Glowing Dawn an, einem geheimen Team, das abtrünnige Digimon und die dunkle Wahrheit eines Systems untersucht, das von Emotionen angetrieben und korrumpiert wird.