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Der Möbelwagen fährt von Stubbes Haus ab. Der Kommissar winkt seiner Tochter Christiane nach und begreift plötzlich, wie sehr sich sein Leben verändern wird. Seine Pensionierung steht unmittelbar bevor, Christiane bezieht mit Helge eine eigene Wohnung, und seine Freundin Marlene wird schon in wenigen Tagen zu ihrer neuen Arbeitsstelle nach Dresden aufbrechen. Ohne ihn, denn Stubbe hat sich entschlossen, der Familie wegen in Hamburg, seiner Wahlheimat, zu bleiben. Prompt beschert ihm sein Beruf einen besonders kniffeligen Fall. Mitten im Trainingsspiel bricht die beliebte Rollstuhlbasketballerin Maria zusammen: Irgendjemand muss der jungen Frau eine Giftspritze in ihr gelähmtes Bein injiziert haben. Stubbe vermutet eine Beziehungstat, denn die Tote war schwanger. Seine Ermittlungen konfrontieren Stubbe mit einer ihm völlig fremden Lebenswelt.
„Mordfall Maria“ ist die letzte neue Folge der Reihe „Stubbe – Von Fall zu Fall“. Nach 20 Jahren und 50 Folgen verabschiedet sich das erfolgreiche Samstags-Krimi Format von seinem Publikum.